De esos días recuerda al profesor Baratech y  al protector Francisco Cebrián, entonces  director del centro. En el edificio de Comercio le dieron clase Gella, don Pedro Gómez, Amador, Rafael Ibarra y Allué Salvador. Tras la guerra, Baratech y profesores nuevos: Moreno Alcañiz y José Manuel Blecua, que les impartió clase durante el curso 1940-1941, en 7ª de bachillerato.

Alvar formó parte de una generación excepcional, la promoción 1934-1941, a la que pertenecían varios alumnos que llegaron a catedráticos universitarios —además de Alvar, Joaquín Bosque, Gustavo Bueno, Constantino Láscaris, Lázaro Carreter, Félix  Monge y Antonio Ubieto—, y dos de ellos —Lázaro Carreter y Alvar—, a directores de la RAE. El profesor Blecua fue determinante para que  esos alumnos —tres de los cuales  se convertirían en  eminentes  filólogos: el propio Alvar, Fernando Lázaro Carreter  y Félix Monge Casao—, decidieran estudiar Filosofía y Letras. De Félix Monge recuerda que los desarmó con su bondad cuando le pusieron la zancadilla y, a partir de  entonces, se hicieron amigos. En el paseo de las Damas (por donde se accedía al edificio de jesuitas), “a pedrada limpia”, vio por primera vez a Lázaro Carreter el día en que ambos encontraron su nombre en la lista que les abría las puertas del Goya. Fueron los dos únicos alumnos de las preparatorias que acabaron el bachillerato siete años después.

Alvar, Lázaro Carreter y Monge cursaron los dos años de comunes en la Universidad de Zaragoza, adonde se acababa  de incorporar  como catedrático de Literatura  Francisco Ynduráin, al que Alvar calificó de “milagro” en una “triste Universidad”. Ynduráin logró entusiasmarlos no solo como profesor de literatura sino también con sus explicaciones de gramática histórica. Allí se les unió el jacetano Tomás Buesa Oliver, que se convertiría en amigo entrañable y colaborador de Alvar.  Lázaro Carreter y Félix Monge  marcharon después a Madrid, en cuya Universidad Central cursaron los tres años de especialidad en Filología Románica, inexistente en Zaragoza. Alvar y Buesa, sin embargo, continuaron esos estudios en Salamanca, de cuya Facultad de Letras era decano el aragonés José María Ramos y Loscertales, amigo de Unamuno. Eran los años de las cartillas de racionamiento y del estraperlo, de viajes en trenes renqueantes o por carreteras llenas de baches.  Alvar y Buesa se hospedaron en casa de Julia de Valiente, que había sido niñera de la familia Unamuno. En Salamanca coincidieron con Agustín García Calvo, Carmen Martín Gaite e Ignacio Aldecoa, con quienes llegaron a hacer teatro. Manuel Alvar se licenció en 1945 con la calificación de sobresaliente y Premio Extraordinario. En la orla de Filología Románica del curso 1944-1945 figuran nueve mujeres y tres varones.

En 1941 Alvar había ganado, por oposición, una beca del Ayuntamiento de Zaragoza que disfrutó hasta acabar la licenciatura. Después fue nombrado becario y colaborador de la Institución Fernando el Católico, de Zaragoza, y profesor auxiliar de los cursos de verano de la Universidad de Zaragoza, en Jaca, lo que le facilitó  el trabajo de campo para preparar su tesis doctoral. En 1945 fue nombrado profesor encargado de cátedra de la Universidad de Salamanca, y al año siguiente se doctoró en la Universidad de Madrid con una tesis, dirigida por Manuel García Blanco,  titulada El habla del campo de Jaca, que mereció la calificación de sobresaliente y Premio Extraordinario, obtuvo el Premio Menéndez Pelayo de Investigación  del CSIC (1946) y fue publicada en 1948. A continuación, el periodo de  prácticas como alférez de Infantería, destinado, con el Regimiento Viriato, a la parte oriental del Pirineo navarro, le permitió iniciar sus estudios sobre todo el dialecto aragonés. En 1947 obtuvo, por oposición, una plaza de profesor adjunto en  Salamanca, en la que  permaneció solo un año pues en 1948, con tan solo veinticinco años, accedió por oposición a la plaza de catedrático de Gramática Histórica de la Lengua Española en la Universidad de Granada.